Мальчик Кун всегда был любим своими родителями, которые постоянно потакали его капризам. Но однажды всё изменилось. Всему виной стало появление маленькой сестрички Куна. В тот же момент родители переключили всё своё внимание на маленькую сестрёнку, что вызвало у Куна волну гнева и ярости. Как-то раз, чувствуя себя подавленным, мальчишка оказывается в необычном магическом саду. Оказалось, в этом саду можно осуществляться путешествия во времени. Мальчик понимает, что у него есть шанс изменить текущий ход событий. Впереди парня ждут невероятные приключения, которые помогут ему стать самым лучшим старшим братом для своей сестры Мирай.

Много лет назад люди были изгнаны с родной планеты ордами ужасных чудовищ и бежали, спасая остатки человечества, на космических кораблях в надежде найти новый дом. А когда надежда окончательно растаяла, и немногие выжившие решили вернуться и сражаться за Землю, они потерпели сокрушительное поражение от нынешнего правителя планеты — Годзиллы. Но вскоре выяснится, что выжили не только сбежавшие в космос. Некоторые люди приспособились к новым условиям и даже создали нетехногенную цивилизацию. Двум группам таких разных теперь людей придется объединить усилия, чтобы противостоять общему врагу.

Трое друзей — Рита, Мишель и Йона — были самыми обычными детьми. Но всё изменилось, когда они предсказали величайшую катастрофу в истории человечества — падение на поверхность Земли огромной космической станции. Они спасли от гибели целый город, но не смогли сохранить своё детство и дружбу. Их прозвали Чудесными детьми и отдали военным учёным для опытов по изучению их суперспособностей. Но разлучило их не это, а обман и предательство. Тогда никто из них даже представить не мог, что через 20 лет судьба сведёт их вновь в глобальной космической битве, но по разные стороны конфликта. Смогут ли любовь и дружба победить в звёздной войне? Или же былые чувства навеки сожжены шквальным огнём гигантских боевых роботов?

Проснувшись на следующий день после своего выпускного, Коёми Арараги осознал, что, словно, стал никем. Его школьная глава жизни уже закончена, а студенческая ещё не начата. Его жизнь стала страшно неопределённой. Но что осталось неизменным, так это странности. Странности, которые в этот раз без преувеличения изменят жизнь Коёми и всех, кого он знает, с точностью до наоборот. Добро пожаловать в мир парадоксов!

После взрыва во время Токийского саммита на сайте появляется тень Тору Амуро, сотрудника Бюро безопасности национального полицейского управления, также известного как Зеро. Также появляется трехликий Рэй Фуруя, известный как детектив и ученик Когоро Мори, но являющийся членом Черного синдиката по имени Бурбон. В результате всех этих событий Когоро ареставан по подозрению в причастности к взрыву. Конан начинает расследование, чтобы доказать невиновность Когоро. Какую роль в расследовании сыграет Амуро?